CGM在线沙龙第七期活动预告 时间:2017年5月24号(星期三),美西时间(Pacific Time)6:00 PM 地点:Youtube https://youtu.be/ijidlmivyz8 (hangout入口需要在直播开始前查看youtube窗口下面的链接) PPT 链接:https://drive.google.com/open?id=0B5AMUSPwO4lreklBWVJrX3FYdGs 题目:Rapidly define crop gene functions using Setaria viridis as a model 主讲人:黄璞 Donald Danforth Plant Science Center (DDPSC) 摘要: 在今天人口爆炸而资源有限的大背景下,通过植物遗传学的手段来改进我们的粮食和能源作物使之获得更大的产量,同时消耗更少的资源是一种重要的解决此矛盾的途径。可是迄今为止,即使在重要传统农作物中,遗传学研究依然进展缓慢。以玉米(Zea mays)为例,作为产量最大的农作物以及传承自上世纪20年代的经典遗传学模式作物,我们也才仅仅对于其六万多个基因中的约五百个的功能有大致的了解。 此项研究中我们展示了一个可能性:一个利用近缘的模式物种——狗尾草(Setaria viridis)来寻找性状相关基因,从而加快作物遗传学研究和作物改良的可能性。我们结合了传统做图方法,大规模测序以及狗尾草的模式生物特性,迅速的找到了一个控制稀穗性状的新基因。这个寻找基因的过程比在玉米中的同类工作节省了超过2/3的时间,成本以及人力资源。通过这一个例,我们展示了狗尾草作为禾本科作物的模式生物的特殊价值,以及有效利用这个模式生物的一种途径。这一工作最近已经发表(https://www.nature.com/articles/nplants201754)。在过去的五年中我们也积累了许多狗尾草的相关资源,这些我都将会介绍一下。我们热诚欢迎各位的探讨和建议,如果对狗尾草有兴趣,或者觉得它对您的研究会有所助益,也欢迎直接联系我。
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时间:2017年05月10 号(星期三),美西时间(Pacific Time)6:00 PM
地点:youtube https://www.youtube.com/watch?v=1Bv0n6Kxaug 注意!hangout入口需要查看youtube链接。 讨论题目:基于版本控制的数据分析及流程管理 讨论主讲人:杨金良 摘要: 子曰:“By three methods we may learn wisdom: first, by reflection, which is noblest; second, by imitation, which is easiest; and third by experience, which is the bitterest.” 子说的当然是中文, 原文为“生而知之者,上也;学而知之者,次也;困而学之者,又其次也;困而不学,民斯为下矣!”。 之所以引孔老夫子的这句话,着实是因为,多年研究经历了一些苦头,痛定思痛,学习总结了一套自认为行之有效的方法。所以,因困而学,我觉得不算太差。 什么样的苦头呢(“困”)呢? 第一:PhD毕业之前半年存了你多年工作脚本的硬盘坏了,你指望着写论文呢,你说你困不困? 第二:文章修改的过程中,让你报告多年前一个数据分析的参数,鬼还记得那个数是几,你说你困不困? 第三:多年来,积累了几十个大大小小的分析,几百个修修补补的图表,几千个改来改去的脚本。这些文件管理起来,困不困!我就问你,困不困! 好了,今天,我们因困而学之,因困而讨论之,不算最差吧。我们将从四个方面展开讨论(参见我的相关博客文章 http://jyanglab.com/2017-01-07-project/)。大家要积极参与哦,结合自身经验,推荐一些好用的工具或可行的方案,最好准备一两张slides。
Video:https://www.youtube.com/watch?v=1Bv0n6Kxaug Slides:https://drive.google.com/open?id=0B5AMUSPwO4lrN0xXbmFFWGVUblE |
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July 2017
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